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中国儿科医学源远流长。远古时期原始社生产力低下，考古发掘出的“北京人”平均龄只有14岁，所以说，中华民族早期的医学积累多数就属于儿科学的范围。在出土的4000年前商代殷墟甲骨文中记载了20余种病名，其中涉及儿科的有“龋”（龋齿）、“蛊”（寄生虫病），直接记载小儿疾病的有“贞子疾首”，是指商王武丁之子头部生病。我国古代史书最早明确记载的 “小儿医”是春秋战国时期的扁鹊。《史记·扁鹊仓公列传》曰：“扁鹊名闻天下……来入咸阳，闻秦人爱小儿，即为小儿医。”记载了春秋战国时期名医扁鹊为“小儿医”的经历，他针刺三阳五会（百会）穴治疗虢国太子“尸厥”，是儿科急症医学的早期记载。从秦到两汉时期，儿科已经有了最早的医案记载，如西汉名医淳于意（仓公）曾以“下气汤”治婴儿“气鬲病”，东汉名医华佗曾以“四物女宛丸”治2岁小儿“下利病”。在我国现存最早的医学专著《五十二病方》中有“婴儿病痫”“婴儿瘛”的记述。尤其值得提出的是，战国时期著名思想家孟子在《孟子·梁惠王上》中所说“幼吾幼以及人之幼”，成为中华民族“爱幼”传统道德观的经典论述。
《黄帝内经》建立的中医学体系不仅有效指导了中医儿科学，而且书中有不少关于小儿生理和儿科疾病的病因、病理、诊法、预后和针刺疗法等论述。《灵枢·经脉》对人体生命孕育和形成过程的描述是“人始生，先成精，精成而脑髓生，骨为干，脉为营，筋为刚，肉为墙，皮肤坚而毛发长，谷入于胃，脉道以通，血气乃行。”《素间·上古天真论》载有对小儿生长发育过程的描述：“女子七岁，肾气盛，齿更发长；二七而天癸至，任脉通，太冲脉盛，月事以时下，故有子……丈夫八岁，肾气实，发长齿更；二八肾气盛，天癸至，精气溢泻，阴阳和，故能有子。”《灵枢·逆顺肥瘦》指出婴儿的生理特点是“肉脆，血少，气弱”。《黄帝内经》中有不少关于儿科疾病诊断、治疗及预后的记载。如《素问·通评虚实论》说：“乳子而病热，脉悬小者何如？岐伯曰：手足温则生，寒则死。”《灵枢·逆顺肥瘦》说：“黄帝曰：刺婴儿奈何……刺此者，以毫针浅刺而疾拔针，日再可也。”这些经典论述，成为后世儿科学起源的渊数。
东汉末年，张仲景著《伤寒杂病论》，以六经辨证论治外感病、脏腑辨证论治杂病，对世儿科学辨证论治体系的形成产生了深刻影响。
西晋王叔和的《脉经·平脉视人大小长短男女逆顺法第五》论述了小儿脉法，认为“小四五岁，脉呼吸八至，细数者，吉。”
南北朝时期，我国已有医学教育。据《唐六典卷十四》记载：“宋元嘉二十年，太医秦承祖奏置医学，以广教授。”说明在南朝宋文帝时，已经设置了政府医学教育。始于南北朝的徐氏世医撰写了多部儿科专著，如徐叔响的《疗少小百病杂方》《疗少小杂方》，徐之才的《小儿方》及《药对》所载的“十剂”等。
