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建立、健全各项标准、法规
逐步形成法制管理体系进入改革开放时期，疫病防治工作取得了很大的进展。1978年国务院批准将传染病管理办法修订为《急性传染病管理条例》。1989年2月我国发布《中华人民共和国传染病防治法》。本法规定管理的传染病为甲、乙、丙三类35种，对传染病的预防、疫情报告和公布、控制、监督和法律责任等方面做了明确规定。
卫生部制订颁发了许多疫病的防治条例、规划、办法、技术方案与手册、考核监测标准与方法等行政性、技术性管理的规章、制度等，使每一种危害严重的急慢性传染病和地方病的防治工作，基本上都有章可循，标志着疫病防治的法规体系已基本形成。
推行计划免疫
大大降低儿童传染病的发病率我国历来重视预防接种工作。尤其近十多年来，成功地实施了儿童规划。根据传染病报告统计，1994年脊髓灰质、麻疹、白喉、百日咳的发病率和残废率约在此开始实施计划免疫的1978年下降97%以上，发病数减少35.2%万例；与解放初比已拯救了2000多万儿童的生命。
1978年卫生部发出《关于加强计划免疫工作的通知》，要求三年内在全国普遍实行儿童计划免疫。1980年颁发《预防接种实施办法》。1982年颁发《全国计划免疫工作条例》、《1982-1990年全国计划免疫工作规划》，明确了使用的疫苗，统一了儿童免疫程序。我国建立了从国家级到乡村级完整的免疫服务机构，保证了实现普及儿童免疫目标，也为初级卫生保健实施奠定了基础。与联合国儿童基金会合作开展了计划免疫-冷链项目，并得到世界卫生组织的技术支持。各生物制品研究所按质按量及时保证疫苗的供应。计划免疫工作改变了以往突击接种的办法，进入了常规持续发展的新阶段。
1985年，我国宣布将分两步实现普及儿童免疫目标，即1988年以省为单位，1990年以县为单位儿童免疫接种率达到85%，并纳入国家“七五”计划。1989和1991年国家卫生部、联合国儿童基金会、世界卫生组织联合审评结果表明，我国按期实现了上述目标，为实现全球普及儿童免疫的目标做出了积极贡献，并得到国际社会的高度评价。
1992年国务院颁布了《九十年代中国儿童发展规划纲要》，明确了“保持高水平免疫接种率，到1995年以乡(镇)为单位儿童免疫接种率达到85%；全国消灭脊髓灰质炎；消除新生儿破伤风；与实行计划免疫前相比麻疹死亡率下降95%，发病率下降90%”等目标。为达到全国消灭脊髓灰质炎目标，国务院批准从1993年开始在全国范围内开展对4岁以下所有儿童2次4轮强化免疫日活动。中央和地方领导人亲自参加了喂服疫苗活动，影响所及全国上下。1995年先后6次组织国内外专家对33省次进行消灭脊髓灰质炎监测工作评估，深入薄弱地区现场指导。强化免疫日活动的成功，在国内外引起极大反响，成为近几年脊髓灰质炎发病迅速下降的一个重要原因。
积极防治、基本控制寄生虫病的流行
（1）血吸虫病：根据血防工作必须坚持长期性、经常性和科学性以及根据实际情况区别对待、分类指导的原则。80年代以来，血防人员区别湖沼型和山丘型流行区域因地制宜采取了化疗控制传染源和消灭易感地带钉螺为主的综合防治措施，提高了防治效果。至1995年，血吸虫病疫情回升势头得到遏制，疫情大幅度下降，压缩了流行范围，减轻了危害。全国慢性血吸虫病人下降了42.5%，急性病人下降了91.77%，病牛数下降了52.5%；已有广东、上海、福建、广西、浙江等五省区市达到消灭血吸虫病的标准，全国386个流行县中，有200个达到消灭标准，63个达到基本消灭标准。为进一步加强血防科研，将“血吸虫疫苗研究”和“长江三峡工程与血吸虫病流行关系的研究”列为重点科研课题，并得到总理基金的支持。
（2）丝虫病：我国丝虫病流行区遍及山东、河南等15个省区市，受威胁人口达3.4亿。经40余年努力，1994年10月，在全国范围基本消灭了丝虫病。据统计，自1956-1993年全国共血检普查丝虫病2亿余人次，海群生治疗2.5亿人次。全民服药3100余万人次，食用海群生药盐1.8亿人次。主要经验是：①列入国家发展规划和防治规划。②加强防治科研的技术咨询，发挥专业人员作用。③有明确的防治目标及科学的防治策略，即以海群生治疗微丝蚴血症以消灭传染源为主导措施的防治策略。
（3）疟疾：通过对大量病人血检，加强了流行病学监测，防治蚊媒等综合防治措施，扩大联防区，到1994年已有14个省区801个县（市），4.75亿人口地区实行疟疾联防；普遍建立疟原虫镜检站，加强疾病监测，使疟疾大幅度下降。1992年全国疟疫情报告数为7.39万，发病率为6.39/10万，与1954年相比，病人99.4%，发病率降低99.5%。全国已有937个县市达到消灭标准、上海、山东达到基本消灭疟疾。
我国首次人体寄生虫病分布调查自1986年开始1992年结束。基本摸清了全国人体寄生虫病的感染情况，为我国有计划、有重点地开展防治工作，提供了科学依据。
