一、本次整理以徐行《医学蒙求》清嘉庆十四年(1809)刻本为底本,这是现存此书最早的传本,以舒松摩重刻《薛生白医师秘笈》清嘉庆十七年(1812)写韻楼刻本为主校本,以章楠《医门棒喝》清道光九年(1829)刻本为他校本,并参考王孟英《温热经纬》清咸丰二年(1852)刻本及潘道根《湿热论批本》清咸丰二年(1852)抄本。
二、凡底本不误而校本有误者,不予改动。底本有语义不通之处,而校本通顺者,据校本改。
三、本书采用横排、简体,现代标点。容易产生歧义的简体字,则仍使用原繁体(如本书所据底之刊刻者为“写韻楼”,不改为“写韵楼”;薛氏又被称为“徵君”,不改为“征君”等)。
四、该书药名有与今通行之名用字不同者,为便利当代读者使用,一般改用通行之名(如“石羔”改作“石膏”等)。药物异名、或能体现时代用药特征的药名不改(如“香茹”不改做“香薷”;“大力子”不改做“牛蒡子”等)。
五、底本中医名词术语用字与今规范用语不同者,为便利当代读者使用,一般改用规范用语(如“胃府”改作“胃腑”、“心胞”改作“心包”、“熄风”改作“息风”等)。尤其是书中一字二形的情况,据目前规范的情况统一为其中之一者(如“癍”与“斑”,作为皮肤病态出现时,统一作“癍”等)。
六、原书书后附有徐行的按语,因此按是对湿热病论治的讨论,有利于对《湿热论》的理解,故予以保留。

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